Le Jardin botanique de Bordeaux exerce les missions suivantes :
- conservation des espèces botaniques régionales, s'appuyant entre autre sur un des plus célèbres herbiers de France,
- actions de sensibilisation du public (visites, stages pédagogiques),
- échanges scientifiques dans l'environnement botanique,
- conseil et expertise dans tous les domaines concernant les plantes.
Le Jardin botanique de Bordeaux a connu un développement spectaculaire avec l'ouverture d'un nouvel espace à la Bastide de 4 ha (en 2003) qui qui complète l'établissement historique situé dans le
Jardin Public (1 ha). En 2007, cette partie du Jardin botanique de la Bastide s'est dotée d'un ensemble administratif, d'un accueil du public et de serres de présentation et de conservation.